北京茅以升科技教育基金会理事会是基金会的法人代表机构和领导管理机构,其职权为决定资金的募集、管理和使用,审定年度收支预算和决算,制定和检查年度工作计划,决定相关机构的人事任免,审议工作报告,决定机构设置、制度制定及其它重大事项。

      第三届北京茅以升科技教育基金会理事会理事长为第九、十、十一届全国政协委员、北京茅以升科技教育基金会原理事长茅玉麟;副理事长为中国铁路总公司总工程师郑健,中国铁道科学研究院集团有限公司党委书记、董事长周黎,中国土木工程学会秘书长李明安;秘书长为中国铁道科学研究院集团有限公司环保所原副所长邱慧;理事为中国科协科普部部长白希,中国铁建股份有限公司副总裁王立新,中国中铁股份有限公司总工程师孔遁,九三学社中央原副秘书长兼参政议政部部长赵勇,北京交通大学党委常委、副校长关忠良,西南交通大学党委常委、副校长蒲云,中国人寿保险股份有限公司科技园区总经理车安兰,北京茅以升科技教育基金会副秘书长茅为中,爱伦,共有十四人。